学校1978年开始招收研究生，1981年获得硕士学位授予权，2011年获批6个一级学科硕士学位授予权。现拥有6个一级学科硕士点，47个二级学科硕士点，5个专业学位硕士点。
★ 一级学科硕士点
| ◆ 基础医学 |
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| ◆ 临床医学 |
| ◆ 口腔医学 |
| ◆ 公共卫生与预防医学 |
| ◆ 药学 |
| ◆ 护理学 |
★ 二级学科硕士点
| ◆ 病理学与病理生理学 |
◆ 人体解剖与组织胚胎学 |
| ◆ 免疫学 |
◆ 病原生物学 |
| ◆ 法医学 |
◆ 放射医学 |
| ◆ 毒理学 |
◆ 民族药药理学 |
| ◆ 转化医学 |
◆ 民族药药物代谢动力学 |
| ◆ 生物医学 |
◆ 内科学（心血管病、血液病、呼吸病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、传染病） |
| ◆ 儿科学 |
◆ 老年医学 |
| ◆ 神经病学 |
◆ 精神病与精神卫生学 |
| ◆ 皮肤病与性病学 |
◆ 影像医学与核医学 |
| ◆ 临床检验诊断学 |
◆ 外科学（骨外、普外、神外、泌外、胸外、整形烧伤外） |
| ◆ 妇产科学 |
◆ 眼科学 |
| ◆ 耳鼻咽喉科学 |
◆ 肿瘤学 |
| ◆ 康复医学与理疗学 |
◆ 运动医学 |
| ◆ 麻醉学 |
◆ 急诊医学 |
◆ 重症医学 |
◆ 口腔基础医学 |
◆ 口腔临床医学 |
◆ 流行病与卫生统计学 |
◆ 劳动卫生与环境卫生学 |
◆ 营养与食品卫生学 |
◆ 儿少卫生与妇幼保健学 |
◆ 卫生毒理学 |
◆ 社会医学与卫生事业管理学 |
◆ 药物化学 |
◆ 药剂学 |
◆ 生药学 |
◆ 药物分析学 |
◆ 微生物与生化药学 |
◆ 药理学 |
◆ 药事管理学 |
◆ 细胞生物学 |
◆ 生物化学与分子生物学 |
◆ 针灸推拿学 |
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★ 专业学位硕士点
| ◆ 临床医学 |
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| ◆ 口腔医学 |
| ◆ 公共卫生硕士 |
| ◆ 体育硕士 |
| ◆ 应用心理硕士 |
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